Faire revenir les courgettes coupées en dès dans un peu d'huile d'olive pendant quelques minutes, avec sel et poivre. Réserver.
Préparer l'appareil à clafoutis : mélanger dans un saladier les œufs, le lait, le basilic, le sel et le poivre. Ajouter la farine et bien mélanger.
Déposer au fond des moules les dès de courgettes, les olives noires coupées en rondelles, et la mozzarella en petits dès. Recouvrir de l'appareil à clafoutis. Cuire au four à 180°C pendant 20 minutes environ.